Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc4a4O88343 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc4a4O88343 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc4a4O88343 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms