Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vamp4O70480 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vamp4O70480 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms