Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BckdkO55028 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BckdkO55028 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BckdkO55028 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms