Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Chil3O35744 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Chil3O35744 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms