Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efna3O08545 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efna3O08545 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms