Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm20828J3KMI7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gm20828J3KMI7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm20828J3KMI7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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