Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
2610001J05RikF2Z3Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms