Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdh18E9Q9Q6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdh18E9Q9Q6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms