Protein–RNA interactions for Protein: E9PVP9

Gm4884, Predicted gene 4884, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4884E9PVP9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm4884E9PVP9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm4884E9PVP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms