Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brpf1B2RRD7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brpf1B2RRD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms