Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd4A2AKM2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms