Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col9a3A2ACT7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col9a3A2ACT7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms