Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U0

Psma7, Proteasome subunit alpha type-7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma7Q9Z2U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Psma7Q9Z2U0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma7Q9Z2U0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma7Q9Z2U0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms