Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Arpc1bQ9WV32 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arpc1bQ9WV32 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms