Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cry2Q9R194 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cry2Q9R194 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.2 ms