Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plod3Q9R0E1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plod3Q9R0E1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms