Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fscn3Q9QXW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fscn3Q9QXW4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms