Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col5a3Q9JLI2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col5a3Q9JLI2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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