Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3glb1Q9JK48 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3glb1Q9JK48 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3glb1Q9JK48 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms