Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sh3bgrlQ9JJU8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh3bgrlQ9JJU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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