Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn19Q9ET38 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cldn19Q9ET38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn19Q9ET38 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms