Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snap29Q9ERB0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snap29Q9ERB0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms