Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SgshQ9EQ08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SgshQ9EQ08 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms