Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Xab2Q9DCD2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xab2Q9DCD2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms