Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrpraQ9DBG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrpraQ9DBG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms