Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S0

Lypd8, Ly6/PLAUR domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd8Q9D7S0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lypd8Q9D7S0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lypd8Q9D7S0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lypd8Q9D7S0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms