Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1K7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D1K7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms