Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan11Q9D1D1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan11Q9D1D1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.9 ms