Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkrip1Q9CWV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkrip1Q9CWV6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prkrip1Q9CWV6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms