Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtpbp4Q99ME9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gtpbp4Q99ME9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms