Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms