Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Supt16hQ920B9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Supt16hQ920B9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms