Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ptx4Q6RUU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptx4Q6RUU0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptx4Q6RUU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms