Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ggnbp1Q6K1E7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms