Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zic3Q62521 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zic3Q62521 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms