Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mre11Q61216 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms