Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc125Q5U465 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc125Q5U465 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc125Q5U465 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms