Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc88aQ5SNZ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms