Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmtc2Q56A06 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmtc2Q56A06 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc2Q56A06 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms