Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fam228bQ497Q6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam228bQ497Q6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam228bQ497Q6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms