Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C87499Q3UX49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C87499Q3UX49 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms