Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctu2Q3U308 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu2Q3U308 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms