Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Srsf6Q3TWW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms