Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc10Q3TLI0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc10Q3TLI0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc10Q3TLI0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.6 ms