Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim63Q38HM4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim63Q38HM4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms