Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ptchd1Q14B62 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ptchd1Q14B62 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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