Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Siah2Q06986 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah2Q06986 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms