Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r236Q05A06 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r236Q05A06 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms