Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Xrn1P97789 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Xrn1P97789 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xrn1P97789 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms