Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psme1P97371 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme1P97371 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Psme1P97371 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Psme1P97371 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme1P97371 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms